Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med17Q8VCD5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med17Q8VCD5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med17Q8VCD5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms