Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops8Q8VBV7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops8Q8VBV7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cops8Q8VBV7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops8Q8VBV7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms