Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ApobrQ8VBT6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ApobrQ8VBT6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms