Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Top1mtQ8R4U6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Top1mtQ8R4U6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top1mtQ8R4U6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top1mtQ8R4U6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top1mtQ8R4U6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top1mtQ8R4U6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Top1mtQ8R4U6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top1mtQ8R4U6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top1mtQ8R4U6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top1mtQ8R4U6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Top1mtQ8R4U6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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Top1mtQ8R4U6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Top1mtQ8R4U6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms