Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg10Q8R1P4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atg10Q8R1P4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg10Q8R1P4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms