Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc137Q8R0K4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc137Q8R0K4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc137Q8R0K4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms