Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef8Q8CE24 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef8Q8CE24 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef8Q8CE24 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms