Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lancl3Q8CD19 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lancl3Q8CD19 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lancl3Q8CD19 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl3Q8CD19 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms