Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8CC96 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8CC96 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8CC96 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q8CC96 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CC96 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CC96 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CC96 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CC96 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CC96 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CC96 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CC96 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CC96 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CC96 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CC96 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CC96 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CC96 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CC96 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CC96 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CC96 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CC96 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CC96 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CC96 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CC96 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CC96 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CC96 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CC96 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CC96 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CC96 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CC96 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CC96 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CC96 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CC96 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CC96 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CC96 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CC96 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CC96 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CC96 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CC96 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CC96 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CC96 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CC96 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CC96 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CC96 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CC96 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CC96 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CC96 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CC96 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CC96 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CC96 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CC96 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CC96 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CC96 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CC96 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CC96 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CC96 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CC96 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CC96 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CC96 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CC96 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CC96 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CC96 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CC96 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CC96 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CC96 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CC96 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CC96 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CC96 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CC96 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CC96 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CC96 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CC96 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CC96 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CC96 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CC96 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CC96 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CC96 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CC96 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CC96 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CC96 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CC96 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CC96 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CC96 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CC96 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CC96 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CC96 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CC96 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CC96 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CC96 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CC96 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CC96 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CC96 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CC96 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CC96 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CC96 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CC96 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CC96 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CC96 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CC96 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CC96 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms