Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc15Q8C9M2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc15Q8C9M2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc15Q8C9M2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms