Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spef2Q8C9J3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Spef2Q8C9J3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms