Protein–RNA interactions for Protein: Q8C494

Prr33, Proline-rich protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr33Q8C494 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr33Q8C494 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr33Q8C494 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms