Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q2

Zhx3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zhx3Q8C0Q2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zhx3Q8C0Q2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zhx3Q8C0Q2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zhx3Q8C0Q2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zhx3Q8C0Q2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms