Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUE1

Slc9a4, Sodium/hydrogen exchanger 4, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a4Q8BUE1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a4Q8BUE1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a4Q8BUE1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a4Q8BUE1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a4Q8BUE1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms