Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup54Q8BTS4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup54Q8BTS4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup54Q8BTS4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup54Q8BTS4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup54Q8BTS4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup54Q8BTS4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup54Q8BTS4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup54Q8BTS4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup54Q8BTS4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup54Q8BTS4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup54Q8BTS4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup54Q8BTS4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup54Q8BTS4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup54Q8BTS4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms