Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TicrrQ8BQ33 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TicrrQ8BQ33 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TicrrQ8BQ33 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TicrrQ8BQ33 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms