Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM92

Cdh7, Cadherin-7, mousemouse

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh7Q8BM92 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh7Q8BM92 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh7Q8BM92 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh7Q8BM92 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh7Q8BM92 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh7Q8BM92 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh7Q8BM92 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh7Q8BM92 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh7Q8BM92 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh7Q8BM92 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh7Q8BM92 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh7Q8BM92 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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