Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trpa1Q8BLA8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpa1Q8BLA8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpa1Q8BLA8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms