Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npas4Q8BGD7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npas4Q8BGD7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Npas4Q8BGD7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Npas4Q8BGD7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Npas4Q8BGD7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Npas4Q8BGD7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Npas4Q8BGD7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Npas4Q8BGD7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Npas4Q8BGD7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npas4Q8BGD7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npas4Q8BGD7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms