Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8BGC1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGC1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGC1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGC1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8BGC1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGC1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGC1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGC1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8BGC1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8BGC1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8BGC1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8BGC1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms