Protein–RNA interactions for Protein: Q810P3

Cdkn3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn3Q810P3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn3Q810P3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdkn3Q810P3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn3Q810P3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms