Protein–RNA interactions for Protein: Q810P2

Odf3l1, Outer dense fiber protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3l1Q810P2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3l1Q810P2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3l1Q810P2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3l1Q810P2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3l1Q810P2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3l1Q810P2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf3l1Q810P2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf3l1Q810P2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms