Protein–RNA interactions for Protein: Q80X59

Tmco5b, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5bQ80X59 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmco5bQ80X59 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmco5bQ80X59 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmco5bQ80X59 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tmco5bQ80X59 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms