Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thnsl2Q80W22 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thnsl2Q80W22 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thnsl2Q80W22 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thnsl2Q80W22 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thnsl2Q80W22 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Thnsl2Q80W22 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thnsl2Q80W22 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thnsl2Q80W22 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thnsl2Q80W22 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thnsl2Q80W22 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Thnsl2Q80W22 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms