Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mcph1Q7TT79 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcph1Q7TT79 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcph1Q7TT79 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcph1Q7TT79 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcph1Q7TT79 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms