Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed3Q78IS1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed3Q78IS1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed3Q78IS1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms