Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SynmQ70IV5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SynmQ70IV5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SynmQ70IV5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SynmQ70IV5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SynmQ70IV5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SynmQ70IV5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SynmQ70IV5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SynmQ70IV5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SynmQ70IV5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms