Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne1Q6ZWR6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms