Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Flrt1Q6RKD8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Flrt1Q6RKD8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flrt1Q6RKD8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms