Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr13Q6R5N8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tlr13Q6R5N8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tlr13Q6R5N8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.2 ms