Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SvoplQ6PDF3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SvoplQ6PDF3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SvoplQ6PDF3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms