Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trak1Q6PD31 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Trak1Q6PD31 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Trak1Q6PD31 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Trak1Q6PD31 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Trak1Q6PD31 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms