Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slf2Q6P9P0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slf2Q6P9P0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slf2Q6P9P0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slf2Q6P9P0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slf2Q6P9P0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slf2Q6P9P0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slf2Q6P9P0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Slf2Q6P9P0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slf2Q6P9P0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slf2Q6P9P0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slf2Q6P9P0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slf2Q6P9P0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slf2Q6P9P0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms