Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp2d40Q6P8N9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp2d40Q6P8N9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cyp2d40Q6P8N9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2d40Q6P8N9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms