Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcf1Q6P542 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcf1Q6P542 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcf1Q6P542 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcf1Q6P542 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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