Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Slx4Q6P1D7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Slx4Q6P1D7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Slx4Q6P1D7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Slx4Q6P1D7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms