Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc189Q6NZQ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc189Q6NZQ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms