Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB0

Dnajc8, DnaJ homolog subfamily C member 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc8Q6NZB0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc8Q6NZB0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc8Q6NZB0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc8Q6NZB0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.2 ms