Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fndc3c1Q6DFV6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc3c1Q6DFV6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms