Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
N4bp1Q6A037 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp1Q6A037 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp1Q6A037 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms