Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ltn1Q6A009 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltn1Q6A009 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltn1Q6A009 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltn1Q6A009 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltn1Q6A009 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltn1Q6A009 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltn1Q6A009 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltn1Q6A009 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltn1Q6A009 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ltn1Q6A009 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ltn1Q6A009 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ltn1Q6A009 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ltn1Q6A009 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 322.3 ms