Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn3Q64691 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Capn3Q64691 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn3Q64691 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms