Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim24Q64127 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim24Q64127 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim24Q64127 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
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