Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhocQ62159 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RhocQ62159 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhocQ62159 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhocQ62159 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RhocQ62159 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhocQ62159 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhocQ62159 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RhocQ62159 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RhocQ62159 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RhocQ62159 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms