Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prg2Q61878 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prg2Q61878 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prg2Q61878 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prg2Q61878 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prg2Q61878 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prg2Q61878 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prg2Q61878 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prg2Q61878 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms