Protein–RNA interactions for Protein: Q61851

Fgfr3, Fibroblast growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr3Q61851 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgfr3Q61851 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgfr3Q61851 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr3Q61851 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms