Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cln3Q61124 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cln3Q61124 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cln3Q61124 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cln3Q61124 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.3 ms