Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf3Q60803 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3Q60803 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3Q60803 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms