Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prdm1Q60636 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm1Q60636 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms