Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myh1Q5SX40 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Myh1Q5SX40 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Myh1Q5SX40 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myh1Q5SX40 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myh1Q5SX40 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myh1Q5SX40 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myh1Q5SX40 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myh1Q5SX40 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myh1Q5SX40 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Myh1Q5SX40 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Myh1Q5SX40 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms